生命科学データベース・ウェブツール

生命科学データベース・ウェブツール

図解と動画で使い方がわかる! 研究がはかどる定番18選

 

著者名:監修:坊農秀雅 大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS) 特任准教授/小野浩雅 大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS) 特任助教

出版社:MEDSI

出版年月:2018年11月


書籍 新刊

ISBNコード:9784815701437

数量

価格:¥3,080(税込)

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目次情報 内容紹介 推薦人

Part 1 生命科学系研究室の新人が絶対に知っておくべき5 つのツール
1章 PubMed で論文を効率的に検索する
2章 PowerPoint で欲しいイラストを描く
3章 Google のサービスを活用する
4章 BLAST で遺伝子の配列類似性検索をする
5章 PCR プライマーを設計する- Primer3Plus とPrimer-BLAST

Part 2 「 仮説・実験・解析・出版」の研究サイクルを加速させる便利なツール
6 章 ImageJ で画像ファイルを操作する
7 章 ゲノムブラウザを使って遺伝子を知る─ UCSC Genome Browser など
8 章 英語表現や略語をすばやく検索する─ inMeXes とAllie
9 章 最新知見を日本語で知る・読む・学ぶ─新着論文レビューと領域融合レビュー

Part 3 生命科学系データ解析の現場で,押さえておきたい「鉄板」ツール
10 章 MEGAで系統樹を作成する
11 章 RefEx とChip-Atlas で公共の遺伝子発現データを快適に検索する
12 章 Metascapeでエンリッチメント解析をして自分の持つ遺伝子リストを解釈する

Part 4 ビッグデータ時代の疾患ゲノム解析で使いこなしたいデータベース
13 章 TCGAで各がん種の公開データのダウンロードや解析を行う
14 章 COSMIC でがん遺伝子の体細胞変異を調べる
15 章 GWAS Catalog で形質とバリアントの関連について検索する
16 章 ClinVar で疾患に関連するバリアントを検索する
17 章 gnomAD でヒトのエキソームやゲノムのデータから変異を探す
18 章 GTEx Portal でヒトの各組織での遺伝子発現量や影響するeQTL を調べる

付録 動画作製の舞台裏

カートの中身

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